Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PdcQ9QW08 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdcQ9QW08 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms