Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gkap1Q9JMB0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gkap1Q9JMB0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gkap1Q9JMB0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gkap1Q9JMB0 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gkap1Q9JMB0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gkap1Q9JMB0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gkap1Q9JMB0 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gkap1Q9JMB0 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gkap1Q9JMB0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gkap1Q9JMB0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gkap1Q9JMB0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gkap1Q9JMB0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gkap1Q9JMB0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gkap1Q9JMB0 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gkap1Q9JMB0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gkap1Q9JMB0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gkap1Q9JMB0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gkap1Q9JMB0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gkap1Q9JMB0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gkap1Q9JMB0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gkap1Q9JMB0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gkap1Q9JMB0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gkap1Q9JMB0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gkap1Q9JMB0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gkap1Q9JMB0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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