Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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