Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms