Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ybx3Q9JKB3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ybx3Q9JKB3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms