Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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