Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms