Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms