Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpr88Q9EPB7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpr88Q9EPB7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms