Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Rnft1Q9DCN7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Rnft1Q9DCN7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rnft1Q9DCN7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rnft1Q9DCN7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rnft1Q9DCN7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rnft1Q9DCN7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rnft1Q9DCN7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rnft1Q9DCN7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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