Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufa8Q9DCJ5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufa8Q9DCJ5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms