Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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