Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnn3Q9DAW9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms