Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b2Q9D9N2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b2Q9D9N2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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