Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Derl3Q9D8K3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms