Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmtm5Q9D6G9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms