Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms