Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc105Q9D4K7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms