Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms