Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap53Q9D439 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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