Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms