Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms