Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms