Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms