Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms