Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms