Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shisa9Q9CZN4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms