Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tmem39aQ9CYC3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39aQ9CYC3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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