Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kdm8Q9CXT6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms