Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXF7

Chd1l, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1-like, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1lQ9CXF7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Chd1lQ9CXF7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Chd1lQ9CXF7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Chd1lQ9CXF7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Chd1lQ9CXF7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Chd1lQ9CXF7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Chd1lQ9CXF7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Chd1lQ9CXF7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Chd1lQ9CXF7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd1lQ9CXF7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd1lQ9CXF7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd1lQ9CXF7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd1lQ9CXF7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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