Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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