Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
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