Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Nicn1Q9CQM0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Nicn1Q9CQM0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms