Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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