Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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