Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms