Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Use1Q9CQ56 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Use1Q9CQ56 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Use1Q9CQ56 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Use1Q9CQ56 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Use1Q9CQ56 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Use1Q9CQ56 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Use1Q9CQ56 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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