Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ssxb1Q9CPU1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ssxb1Q9CPU1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ssxb1Q9CPU1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ssxb1Q9CPU1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ssxb1Q9CPU1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ssxb1Q9CPU1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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