Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim3Q99PE5 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms