Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cep41Q99NF3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms