Protein–RNA interactions for Protein: Q99N85

Mrps18a, 28S ribosomal protein S18a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps18aQ99N85 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrps18aQ99N85 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrps18aQ99N85 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms