Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms