Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nus1Q99LJ8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms