Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnpo2Q99LG2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms