Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Vmp1Q99KU0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmp1Q99KU0 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmp1Q99KU0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmp1Q99KU0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmp1Q99KU0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmp1Q99KU0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Vmp1Q99KU0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmp1Q99KU0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmp1Q99KU0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmp1Q99KU0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmp1Q99KU0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmp1Q99KU0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmp1Q99KU0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Vmp1Q99KU0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmp1Q99KU0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmp1Q99KU0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Vmp1Q99KU0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Vmp1Q99KU0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Vmp1Q99KU0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Vmp1Q99KU0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmp1Q99KU0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmp1Q99KU0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmp1Q99KU0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmp1Q99KU0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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