Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms