Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rab28Q99KL7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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