Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ubxn2aQ99KJ0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ubxn2aQ99KJ0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ubxn2aQ99KJ0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ubxn2aQ99KJ0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ubxn2aQ99KJ0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ubxn2aQ99KJ0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ubxn2aQ99KJ0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ubxn2aQ99KJ0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ubxn2aQ99KJ0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ubxn2aQ99KJ0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ubxn2aQ99KJ0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ubxn2aQ99KJ0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ubxn2aQ99KJ0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ubxn2aQ99KJ0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ubxn2aQ99KJ0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ubxn2aQ99KJ0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms