Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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TirapQ99JY1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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TirapQ99JY1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
TirapQ99JY1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms