Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pacsin3Q99JB8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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